L'orgue a été inauguré le 16 décembre 2001 à l'initiative de la Municipalité et de l'association Les Amis de l'Orgue.
Extrait du discours inaugural de Monsieur Foulquier, ancien Maire de Seysses :
«Les orgues, dont nous célébrons la restauration aujourd’hui, ont été classés dans le patrimoine historique en 1995. Installés en 1867, instrument romantique de la facture Théodore PUGET et Fils, ils sont constitués d’éléments peut être plus anciens. Depuis cette date, des modifications diverses ont été apportées en 1900 et 1950. Permettez-moi d’évoquer un souvenir personnel de ma jeunesse : l’organiste de l’époque, avant la guerre, Monsieur LAFFONT, personne âgée qui avait manifesté son talent à la cathédrale St Etienne, vieux seyssois, nous prenait à la demande de l’Abbé Gaubert, pour souffler comme nous le disions à l’époque, après le catéchisme, afin de pouvoir assurer son fonctionnement.
C’était très dur à deux sur les pédales car nous n’étions pas très lourds, et souvent nous le laissions sans souffle, lorsque nous estimions, sans doute à tort, qu’il nous en demandait un peu trop.
Après sa disparition pendant la guerre, l’orgue est resté souvent muet, diverses personnes plus ou moins compétentes se succédant pour assurer son fonctionnement (Messieurs Gagnère, Chaumeton et autres). Puis il devint injouable.
La restauration de l’orgue est en quelque sorte la conclusion d’une longue série de travaux réalisés dans notre église pour la rendre accueillante.
A partir de 1960, après l’installation du chauffage (type romain) par l’Abbé Cucuroux, et dès 1970 avec des conseils municipaux successifs, nous avons entrepris une restauration complète de ce magnifique édifice. Réfection totale de la toiture y compris les chapelles qui menaçaient de s’écrouler, des vitraux que les déflagrations de la guerre et la vétusté avaient détériorés. Réfection de toutes les peintures des chapelles à l’identique par un artiste professionnel, réfection totale de l’ensemble de l’alimentation électrique très disparate (qui menaçait la sécurité), remplacement des abats sons.
Et aussi, reprise du crépi sur toutes les parties latérales, identique à l’originel. Ces travaux d’une valeur considérable sont couronnés aujourd’hui par la mise en place de l’orgue par la volonté d’une association seyssoise, créée sous l’égide de l’Abbé Maye, avec l’accord de la municipalité.
Après appel d’offres, Monsieur Jean DALDOSSO que nous remercions vivement, facteur d’orgues à Gimont, a été choisi pour effectuer ce travail qui a duré plus d’un an en raison de sa complexité et de quelques imprévus survenus en cours de travaux. Le coût de cet ensemble d’opérations s’est élevé à 846.230,44 F soit 129 006.99 €.»